La diócesis de Añatuya fue erigida por el papa Juan XXIII el 10 de abril de 1961 mediante la bula In Argentina a partir de territorio perteneciente hasta entonces a la diócesis de Santiago del Estero. Su erección fue autorizada por la ley nacional n.°15 804 sancionada el 17 de mayo de 1961.

Su primer obispo fue el siervo de Dios Jorge Gottau, sacerdote redentorista, quien tomó posesión el 1 de octubre de 1961 y estuvo al frente de la diócesis hasta el 19 de diciembre de 1992.

Su lema episcopal era: «A Jesús por María». Gottau, a quien se le conoce como «el obispo de la promoción humana», fue obispo emérito hasta su muerte, el 24 de abril de 1994.